Elaboran una secuencia del genoma de la uva tinta más producida en el mundo

Elaboran una secuencia del genoma de la uva tinta más producida en el mundo

Científicos han elaborado un proyecto de secuencia del genoma de alta calidad de Cabernet Sauvignon, variedad de uva tinta más popular del mundo.

Son el resultado de la nueva tecnología de secuenciación combinado con un nuevo algoritmo informático que puede dar información detallada acerca de genomas complejos de diversos organismos.

El éxito del nuevo montaje del genoma, lo que permite a los investigadores se reúnen grandes segmentos de ADN de un organismo, también se demostró en la investigación común planta Arabidopsis thaliana y el hongo de coral ( Clavicorona pyxidata ). Los resultados aparecen en la revista Nature Methods .

«Para la genómica de la vid, esta nueva tecnología resuelve un problema que ha limitado el desarrollo de recursos genómicos para las variedades de uva de vinificación», dice el investigador principal del trabajo de secuenciación de la Cabernet Sauvignon, Darío Cantu de la Universidad de California, departamento de viticultura y enología.

«El nuevo proceso proporciona un acceso rápido a la información genética que el Cabernet Sauvignon ha heredado de ambos padres, lo que nos permite identificar los marcadores genéticos para utilizar en la obtención de nuevas cepas con características mejoradas», indicó.

La primera secuencia del genoma de la vid común, Vitis vinifera , se completó en 2007. Debido a que se basa en una variedad de vid que se ha generado para simplificar el procedimiento de montaje del genoma, en lugar de una variedad cultivada, esa secuencia carece de muchos de los detalles importantes que la uva de vinificación poseen, dijo Cantu.

Se observa que la nueva tecnología de secuenciación permitirá a su grupo de investigación llevar a cabo estudios comparativos entre el Cabernet Sauvignon y otras variedades de uva de vinificación histórica y económicamente importantes.

«Esto nos ayudará a entender lo que hace que el Cabernet Sauvignon sea Cabernet Sauvignon».

Uvas en un clima más caliente

«La nueva información genómica que se generará con este nuevo enfoque va a acelerar el desarrollo de nuevas variedades de uva de vinificación resistentes a las enfermedades que producen alta calidad, las uvas sabrosas y se adaptan mejor a los cambios ambientales», dice Cantu.

Las temperaturas más cálidas atribuidos al cambio climático ya se están registrando en muchas regiones vitícolas principales del mundo. Y en California, donde el valor de los cultivos de uva es muy variable y está fuertemente influenciado por el clima local, es especialmente importante que las nuevas variedades puedan prosperar a pesar de aumento de las temperaturas.

Un misterio Cabernet Sauvignon

El nuevo esfuerzo de secuenciación también puede responder a algunas de las preguntas que han rodeado la ascendencia de Cabernet Sauvignon durante siglos.

«Tener acceso a esta información genómica es históricamente fascinante», dice Cantu, señalando que la variedad Cabernet Sauvignon se cree hasta la fecha que era del siglo 17. Se señala que en 1997 la genetista de plantas Carole Meredith utilizó técnicas de huella de ADN para identificar a las  Cabernet Franc y Sauvignon Blanc como las dos variedades que habían cruzado para producir Cabernet Sauvignon.

Debido a que las vides de uva se han propagado por esquejes de plantas en lugar de partir de semillas, todas las cepas Cabernet Sauvignon son genéticamente idénticos, con la excepción de algunos, mutaciones espontáneas clonales.

«El uso de este nuevo proceso de secuenciación del genoma, permitirá desarrollar los marcadores genéticos necesarios para combinar rasgos importantes en nuevas variedades», dijo Cantu.

Fuente UC Davis